บาคาร่าเว็บตรงการจัดลำดับจีโนมไม่ใช่เรื่องยากอีกต่อไป

บาคาร่าเว็บตรงการจัดลำดับจีโนมไม่ใช่เรื่องยากอีกต่อไป

ในการสนทนากับ  Sinisa Nikolicผู้อำนวยการและหัวหน้าส่วนงาน HPC & AI, AP, Lenovo ISG, BW Businessworldได้สำรวจโลกแห่งการประมวลผลบาคาร่าเว็บตรงประสิทธิภาพสูง (HPC) ร่วมกับการดูแลสุขภาพและการจัดลำดับจีโนม อ่านต่อสำหรับข้อความที่ตัดตอนมาจากการสัมภาษณ์

บทบาทของ AI และ ML ในการก้าวไปสู่การดูแลสุขภาพเชิงป้องกันจะเป็นอย่างไร? 

AI ถูกใช้ในการดูแลสุขภาพมาเป็นเวลา 5-7 ปีแล้ว แต่มันไม่ได้เน้นไปที่ยาป้องกันอย่างแน่นอน ตัวอย่างเช่น มันถูกนำไปใช้ในด้านเนื้องอกวิทยาสำหรับเส้นทางการรักษา เราได้เห็นการขยายตัวของแอปพลิเคชัน AI นี้อย่างสมบูรณ์และสมบูรณ์ที่สุดในตลาดการดูแลสุขภาพ เหล่านี้เป็นแอปพลิเคชันการเรียนรู้ด้วยเครื่องบำบัดที่ตรงจุดและทันเวลา

จากมุมมองการวิเคราะห์เชิงคาดการณ์ของ AI และสิ่งที่ยอดเยี่ยมจริงๆ ก็คือ ความสามารถในการคาดการณ์ตามอัลกอริทึมที่เราใช้ วันนี้ เราสามารถทำนายปัญหาที่เกี่ยวข้องกับการดูแลสุขภาพได้

รัฐบาลจำนวนมากกำลังทำการเรียนรู้ด้วยเครื่องตามประชากรมากขึ้น (จีโนมตามประชากร) ในการเริ่มการอนุมานจากข้อมูลระดับนั้น ไม่ว่าจะเป็นเรื่องเพศ กลุ่มวัฒนธรรม สถานที่ เศรษฐกิจและสังคม ฯลฯ คุณต้องมีเครื่องมือ AI จริงๆ

ด้วยโครงสร้างพื้นฐาน HPC ที่คุ้มค่าและอิงจาก AI รัฐบาลและองค์กรต่างๆ ใช้จ่ายน้อยลงมากในแต่ละวัน เมื่อเทียบกับการใช้จ่ายหลายล้านใน HPC เมื่อ 5-10 ปีที่แล้ว

เหตุใดการหาลำดับจีโนมจึงเป็นเรื่องยาก อะไรคือความท้าทายที่เกี่ยวข้องกับเทคโนโลยีในเรื่องนี้? 

การจัดลำดับจีโนมไม่ใช่เรื่องยากอีกต่อไป เครื่องมือจัดลำดับวันนี้ อาจใช้เวลา 100-150 ชั่วโมงในการจัดลำดับ DNA ของใครบางคน ฉันก็เลยบอกว่ามันไม่ได้ยาก แต่จริงๆ แล้วก็ยังแพงอยู่ดี มันเร็วขึ้นและดีขึ้น และเมื่อมีระบบ Next-Generation Sequencing (NGS) ออกมามากขึ้น สิ่งเหล่านี้ก็ลดเวลาในการจัดลำดับลงครึ่งหนึ่งอย่างต่อเนื่อง

ในที่สุดเราก็มีเทคโนโลยีที่สามารถทำให้เราเกิดผลในความเร็วที่มนุษย์ต้องการหรือไม่? 

ใช่ เพราะสิ่งต่างๆ เกิดขึ้นเร็วมาก ที่ Lenovo ISG เราเพิ่งเปิดตัว GOAST เวอร์ชันถัดไป และยังคงลดเวลาสำหรับข้อมูลเชิงลึกเหล่านี้ต่อไป กระบวนการนี้ใช้เวลาเป็นวัน 150-200+ ชั่วโมง ตอนนี้ถูกลดระดับลงเหลือนาทีแล้ว เราได้เห็นความเร็วเพิ่มขึ้น 167 เท่า

ขึ้นอยู่กับชุดข้อมูลที่เรากำลังประมวลผล เราเห็นเวลา 150-180 ชั่วโมงลดลงเหลือ 48 นาที และพบว่าลดลงเกือบถึง 12 นาที สิ่งที่น่าสนใจจริงๆ คือ เราไม่ได้ใช้ GPU ซึ่งมีราคาแพงมาก และในขณะที่ฉันพูดถึงระบบที่มีพลังมหาศาล พวกมันก็มีราคาถูกลงด้วย

HPC, AI และคลาวด์คอมพิวติ้งได้รับการสนับสนุนมากขึ้นตั้งแต่เริ่มมีการระบาดใหญ่หรือไม่? คุณสังเกตเห็นการระดมพลและการสนับสนุน HPC มากขึ้นหรือไม่? 

นั่นเป็นคำถามที่ยอดเยี่ยมจากมุมมองของทุกคน เรามีลูกค้าจำนวนมากทั่วโลกที่ต้องหมุนอย่างรวดเร็วอย่างไม่น่าเชื่อเพื่อรองรับพนักงานระยะไกลจำนวนมาก เครือข่ายเครียด อินเทอร์เน็ตเครียด ทุกอย่างเครียด สิ่งที่เราเห็นจากมุมมองของ HPC คือการเติบโต

นอกจากนี้ เรายังเห็นความร่วมมือระหว่างรัฐบาลกับรัฐบาลในการจัดลำดับพันธุกรรมในองค์ประกอบของไวรัส เราผ่านการจัดลำดับ ข้อมูลถูกแบ่งออก คล้ายกับเมืองที่บ้าน แต่ทุกคนก็ลงมือทำ เราเห็นการโฟกัสที่ยั่งยืนภายใน HPC และ AI

คุณช่วยบอกเราเกี่ยวกับความพยายามของคุณในการพัฒนาการวิจัยโรคมะเร็งในอินเดียได้ไหม   

ด้วยเทคโนโลยีของเรา ทีมวิจัย CSIR-IGIB สามารถใช้ GAST ได้ ดังนั้นเราจึงสามารถเริ่มจัดลำดับจีโนมมะเร็งที่เฉพาะเจาะจง และเจาะลึกลงไปในรากเหง้าของยีน เราปรับใช้ระบบที่ค่อนข้างใหญ่ ซึ่งเป็นการติดตั้ง GAST ที่ใหญ่ที่สุดในอินเดียจนถึงปัจจุบัน ใน 28 โหนด

ด้วยการทำงานร่วมกับ CSIR-IGIB เราใช้กระบวนการจัดลำดับจีโนมจาก 60 ชั่วโมงเหลือ 9 ชั่วโมง ซึ่งหมายความว่านักวิจัยสามารถผลักดันงานทางวิทยาศาสตร์ให้มากขึ้นได้ พวกเขาสามารถเพิ่มความซับซ้อนของคำถามที่พวกเขาถามได้ เพราะมีเทคโนโลยีอยู่ข้างหน้าที่สามารถจัดการกับสิ่งเหล่านั้นได้

ในบริบทของข้อมูลจีโนม เราต้องกังวลเกี่ยวกับภัยคุกคามทางไซเบอร์หรือไม่?

เมื่อคุณดูบริการด้านสุขภาพและองค์กรวิจัย พวกเขาจะจัดเก็บข้อมูลจีโนมของข้อมูลผู้ป่วยจำนวนมากอย่างไม่น่าเชื่อ ข้อมูลเป็นความลับและมีค่า แต่อาชญากรไซเบอร์สามารถทำอะไรกับข้อมูลนี้ได้บ้าง วันนี้ไม่เยอะ แต่เมื่อคุณก้าวไปข้างหน้า DNA นี้คือลายนิ้วมือของเรา มันคือชีวิตของเรา มันเหมือนกับหมายเลข PIN ซึ่งเราไม่สามารถเปลี่ยนแปลงได้ ดังนั้น ในอนาคตอันใกล้นี้ หากเราสามารถเก็บรหัสผ่านบาคาร่าเว็บตรง